Mgr. Svatopluk Skoupý, Ph.D.

Vzdělání:
2014-2017: Bakalářské studium oboru Molekulární a Buněčná Biologie na Univerzitě Palackého v Olomouci.
2017-2019: Magisterské studium oboru Molekulární a Buněčná Biologie na Univerzitě Palackého v Olomouci.
2019-2024: Doktorksé sudium oboru Biologie-Botanika na Univerzitě Palackého v Olomouci, disertační práce na téma Populační genomika a biogeografie sinic, a její využítí v moderní taxonomii.
Pracovní pozice:
2019 - 2024: Vědecký pracovník na Katedře Botaniky PřF UP v Olomouci
2024 - (-): Vědecko - akademický pracovník na Katedře Botaniky PřF UP v Olomouci.
Výzkumné pobyty a vzdělávací stáže:
Doktorská stáž v laboratoři prof. Annick Willmotte na Université de Liége, Lutych, Belgie, 2022
13th Poznan Summer School of Bioinformatics, Poznaň, Polsko, 2021
K2 pegagogický kurz pro andragogy a pedagogy volného času, Ostrava, Česká Republika, 2014
Erasmus+ Youth Exchange, Re-thinking Sustainable Cities, Alcamo, Itálie, 2021
Linux v příkazovém řádku a R pro biology, Praha, Česká republika, 2025
Výuka:
Systém nižších rostlin a řas, Univerzita Palackého v Olomouci
Vedení bakalářkských a diplomových prací (1 ukončená, 2 probíhající)
Prezentace na konferencích:
60. konference České algologické společnosti, České Budějovice, Česká Republika (2019)
61. konference České algologické společnosti, Třeboň, Česká Republika (2020, ústní prezentace)
62. konference České algologické společnosti, Třeboň, Česká Republika (2021, ústní prezentace)
64. konference České algologické společnosti, Praha, Česká Republika (2023, ústní prezentace)
65. konference České algologické společnosti, Olomouc, Česká Republika (2024, organizační tým a ústní prezentace, ocenění za nejlepší ústní prezentaci)
22. sympozium Mezinárodní asociace cyanofyt, České Budějovice, Česká Republika (2022, ústní prezentace)
31. studentská konference Chantransia, Jindřichův Hradec, Česká Republika (2021, organizátor a ústní prezentace)
33. studentská konference Chantransia, Telč, Česká Republika (2023, ústní prezentace)
34. studentská konference Chantransia, Rejvíz, Česká Republika (2024, ústní prezentace)
35. studentská konference Chantransia, Prostřední Bečva, Česká Republika (2025, ústní prezentace)
Kongres Federace evropských fykologických společností (FEPS), Brest, Francie (2023, poster + ústní prezentace)
Setkání Polské algologické společnosti, Poznaň, Polsko (2024, ústní prezentace, ocenění za nejlepší ústní prezentaci)
3U – Sympozium tří univerzit, Olomouc, Česká Republika (2024, ústní prezentace)
3U – Sympozium tří univerzit, Neapol, Itálie (2025, ústní prezentace)
XXIV. mezinárodní sympozium kryptogamní botaniky, Pontevedra, Španělsko (2025, ústní prezentace, ocenění za nejlepší ústní prezentaci)
Jazykové dovednosti:
Angličtina - pokročilý
Němčina - mírně pokročilý
Popularizace vědy:
Dvořák P., Skoupý S. (2024) Sinice: inženýři globálního ekosystému. Vesmír, 103:418
Popularizace vědy v rámci projektu Vědátor (autor populárně-naučných článků a internetový stream Týden ve Vědě)
Popularizace Katedry Botaniky na dnech otevřených dveří a Noci vědců
Publikace:
Dvořák P., Skoupý S., Stanojković A., Johansen J.R., Villanueva C., Jung P., Briegel-Williams L., Kaštovksý J., Laughinghouse H.D. IV., Berthold D.E., Lefler F., Hurley A.C., Casamatta D.A. (2025) A hitchhiker's guide to modern, practical cyanobacterial taxonomy. Journal of Phycology, 2025, 00:1-17. DOI: 10.1111/jpy.70102
Skoupý S., Stanojković A., Casamatta D.A., McGovern C., Martinović A., Jaskowiec J., Konderlová M., Dodoková V., Mikesková P., Jahodářová E., Jungblut A.D., van Schalkwyk H., Dvořák P. (2024) Population genomics and morphological data bridge the centuries of cyanobacterial taxonomy along the continuum of Microcoleus species. iScience, 27:e109444. DOI: 10.1016/j.isci.2024.109444
Skoupý S., Stanojković A., Pavlíková M., Poulíčková A., Dvořák P. (2022) New cyanobacterial genus Argonema is hidding in soil crusts around the world. Scientific Reports. 3;12(1):7203. Doi: 0.1038/s41598-022-11288-4
Stanojković A., Skoupý S., Hašler P., Poulíčková A., Dvořák P. (2022) Geography and climate drive the distribution and diversification of the cosmopolitan cyanobacterium Microcoleus (Oscillatoriales,Cyanobacteria). European Journal of Phycology. 57(4):1-10. Doi:10.1080/09670262.2021.2007420
Stanojković A., Skoupý S., Škaloud P., Dvořák P. (2022) High genomic differentiation and limited gene flow indicate recent cryptic speciation within the genus Laspinema (cyanobacteria). Frontiers in Microbiology. 13:977454. Doi: 10.3389/fmicb.2022.977454
Dvořák P., Jahodářová E., Stanojković A., Skoupý S., Casamatta D.A. (2023) Population genomics meets the taxonomy of cyanobacteria. Algal Research, 72:e103128. DOI: 10.1016/j.algal.2023.103128.
Dvořák P., Skoupý S., Jarošová H., Páleníčková K., Stanojković (2024) Population genomics resolves cryptic species of the ecologically flexible genus Laspinema (Cyanobacteria). Journal of Phycology, 60:e13475. DOI: 10.1111/jpy.13475
Stanojković A., Skoupý S., Johannesson H., Dvořák P. (2024) The global speciation continuum of the cyanobacterium Microcoleus. Nature Communications, 15:1. DOI: 10.1038/s41467-024-46459-6
